Muškátový oříšek i květ jsou bohaté na silice, kyselinu muškátovou a alkaloidy.
Muškátový oříšek prospívá srdci, přispívá k lepší náladě. Působí jako přírodní afrodiziakum.
Má silné antiseptické a antibakteriální účinky, zabraňuje vzniku zubního kazu a příznivě působí při zánětů dásní. Zmírňuje projevy revmatismu. Uvolňuje hleny a používá se k domácí léčbě astmatu.
Podporuje chuť k jídlu a klidné trávení. Tiší břišní bolest a křeče, je vhodný ke zmírnění průjmu a nadýmání. Zmírňuje projevy onemocnění slinivky (pankreatidy), nefritidy.
Pozor! Nedoporučuje se při léčbě oxalátových ledvinových kamenů.
Pozor! Ve větším množství působí jako halucinogenní droga – může způsobit třes, křeče a smrt.
Pozor! Ve větším množství může u březích fen vyvolat potrat.
Pozor! K léčebným účelům se nedoporučuje.